Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins3Q9CY94 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms