Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl11Q9CXW4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms