Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpusd4Q9CWX4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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