Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q9CRC3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9CRC3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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