Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rnaseh2cQ9CQ18 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Rnaseh2cQ9CQ18 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rnaseh2cQ9CQ18 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rnaseh2cQ9CQ18 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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