Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GpnmbQ99P91 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms