Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ms4a6bQ99N09 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ms4a6bQ99N09 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms