Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms