Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp11Q99K46 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp11Q99K46 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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