Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krcc1Q99JT5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Krcc1Q99JT5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Krcc1Q99JT5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krcc1Q99JT5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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