Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Klhl22Q99JN2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms