Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ddb2Q99J79 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ddb2Q99J79 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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