Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Apobec3Q99J72 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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