Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc8b1Q925Q3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc8b1Q925Q3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms