Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cldn16Q925N4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Cldn16Q925N4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms