Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prpf6Q91YR7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prpf6Q91YR7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms