Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms