Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hecw1Q8K4P8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms