Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Defb12Q8K4N3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Defb12Q8K4N3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms