Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Vmn1r72Q8K3N7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vmn1r72Q8K3N7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vmn1r72Q8K3N7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms