Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Prpf39Q8K2Z2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Prpf39Q8K2Z2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Prpf39Q8K2Z2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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