Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SrrdQ8K2M3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms