Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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