Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms