Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rdh13Q8CEE7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh13Q8CEE7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh13Q8CEE7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh13Q8CEE7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh13Q8CEE7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rdh13Q8CEE7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms