Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Lrif1Q8CDD9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lrif1Q8CDD9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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