Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atg4aQ8C9S8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4aQ8C9S8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms