Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atg16l1Q8C0J2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms