Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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