Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg4dQ8BGV9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg4dQ8BGV9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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