Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms