Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc28Q80XJ3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms