Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pcsk9Q80W65 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pcsk9Q80W65 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Pcsk9Q80W65 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pcsk9Q80W65 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Pcsk9Q80W65 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Pcsk9Q80W65 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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