Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NischQ80TM9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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