Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
IfnkQ7TSL0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms