Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SynmQ70IV5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms