Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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