Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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