Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Msl2Q69ZF8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms