Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pkp4Q68FH0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pkp4Q68FH0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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