Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms