Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PtprjQ64455 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms