Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TrhQ62361 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrhQ62361 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrhQ62361 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrhQ62361 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms