Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms