Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gli3Q61602 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gli3Q61602 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gli3Q61602 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gli3Q61602 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gli3Q61602 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gli3Q61602 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Slc31a2-202ENSMUST00000107467 868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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