Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ift88Q61371 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ift88Q61371 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ift88Q61371 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ift88Q61371 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ift88Q61371 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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