Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mre11Q61216 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mre11Q61216 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mre11Q61216 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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