Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Traf3Q60803 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms