Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms