Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms